現在表示しているスレッドのdatの大きさは427KBです。
レス数が1000を超えています。残念ながら全部は表示しません。
それから、偶々いくつか手元にログが残っていたのでURLを追ってみた所、
「でん☆すた 高画質テストVer」（後に「でん☆すた のってけ！デンライナー予告編」）
の名前でうｐされていた動画は、恐らくうｐ主さんご自身で削除されたようです。
（「該当する動画はユーザーが削除しました。」と表示されています）
今見たらタグに「完成したら帰ってきます」とあったので、
まだ制作途中段階の物だった為に、頃合いを見て削除なさったのではと。
絶望先生OPの物は、あれは多分ユーザーからの申請でFAだと思いますよ。
一度目の物は確認出来なかったのですが、再うｐの方のページで
コメントを見たら、「特撮同人」というジャンルに属してしまうのがまずかった様です。
（再うｐの方は「該当する動画はユーザーが削除しました。」と表示されていますが、
再うｐに関してかなり揉めていた様なので、他ユーザーからの申請で削除されたのか、
それともうｐ主さん自身で消されたのかは分かりません）
後、確か静止画しか使用していなかった筈の「イマジンが倒せない！(良→侑→龍)」
という動画も削除されていたのですが、これはニコ管理者削除の様です。
このうｐ主さんの他の動画は無事なので、削除理由は分かりませんが…
少なくとも著作権云々ではなさそうです。
（K良のちくびがOUTとかだったら噴くけど、流石にまさかなぁ……）
削除されてしまうと完全に検索にも引っ掛からず、
直リンしないとページに飛べないので、下手をするとうｐ主自身ですら、
マイページから飛べるからいいや〜と思ってブックマークに入れていなかったりすると
ページ（削除理由）を確認出来ないというのがちょっと困ると思うのですが……。
取り敢えず、今のところ著作権問題で（恐らく東Aから）削除されているものは、
「本編の動画使用」の物のみという見方で良いのではないでしょうか。
（静止画、及び自作画像は大丈夫なのではないかと）
勿論、皆さん言われている様に、あくまで「今のところ」としか言えませんが……