スレ立て乙。
分かりやすいテンプレでいいですね。
ffmpegXの解説なら下のサイトもオススメ。
How to Use ffmpegX_2005
ttp://www6.atwiki.jp/how_to_use_ffmpegx/
エンコードソフトは、とりあえずのお試しでMAD作ってみるなら
Adobe Flash CS3の体験版(英語)かFlash Professional 8の体験版が
初心者でも分かりやすくていいかも。
あと、適当にフリーソフト追加
iSquint [動画変換ツール]
ttp://www.isquint.org/
flvファイルをmp4ファイルに変換できます
QuickTime Proが使えない人用。これでiMovieに取り込めます
（perianはOSX10.4しか対応してないので10.3の人はこれが便利）
Clip Creator 2 [書き出しツール]
ttp://kozlowski.umesci.maine.edu/clip_creator/
同じくQuickTime Proが使えない人用かな。
Final Cut Express良さそうですね〜。
値段もお手頃なんで購入迷ってるんですけど
熱しやすく冷めやすいタイプなんで
MAD制作すぐ飽きそうな気がして躊躇してます（＾＾；