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動画とコメントを自動で同期させるためにフリーのDVD再生ソフトを公開している作者に依頼してニコニコDVD側から再生DVDのタイトルと再生中のチャプターと再生時間をリアルタイムに取得できるようにプログラムを改修してもらうのはどうだろう。