運営側から問い合わせの返事あった。
以下転載（転載していいかどうか知らんけど）
>ニコニコ動画では、現状で複数のテレビ関連の権利者から削除依頼を頂いており
>該当すると思われる動画については常時監視のもと
>包括削除という方針を取らせていただいております。
>したがって、お客様が権利を保有していない場合は
>上記の理由に基づき、再度投稿された場合も監視の段階で発見された場合は同様の現象が起こります。
とのこと。
やっぱり１件ずつの削除申請ではなく、ＴＶモノは全部ダメという見解。
それにしては、数万再生のＴＶモノ動画もあることだし徹底してるとは思えないフシもある。
ただ今回の自分の動画削除で（５件削除食らった）アカウントの削除含め停止も何もペナルティは来ていない。
運営側の削除動画に対する振る舞いがまちまちで、ユーザーが混乱しているのは間違いないと思う。