不具合だと判断して投稿致します。
現在投稿可能なユーザーニコ割サイズが544x56に限定されているため、現行プレーヤーとサイズが合いません。
サイズが合わないだけでなく、縦サイズが違うため、ニコ割開始時に動画サイズが強制的に変更されます。
動画サイズ変更は、既存のニコ割を残す為の処置であり、既存のニコ割を一括して再生不可にしないための処置だったことは納得できますが、新たに現在のニコ割サイズに合わせたものを投稿できないのは問題かと思います。
ニコニコムービーメーカーの設定を少々変更するだけで修正対応可能かと思います。
投稿可能なニコ割サイズを現行プレーヤーのサイズへと修正を願います。
「swfファイルでの新規動画投稿(ニコニコムービーメーカー経由)」「スピードチェッカー」の2機能が、6月18日をもって廃止となる。
事実上ユーザーニコ割も廃止ですね